RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511623.1

FAM13A-217, Transcript of family with sequence similarity 13 member A, human

TSL 3

Gene FAM13A, Length 245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM13A-217	ENST00000511623	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	HSD17B6	O14756	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	SLC16A6	O15403	523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	SLC31A2	O15432	143 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	GYG2	O15488	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	FGF16	O43320	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	FAM107A	O95990	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ISG15	P05161	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	F2RL1	P55085	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CFHR3	Q02985	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	BNIP1	Q12981	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	GPR50	Q13585	617 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	EBI3	Q14213	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	KISS1	Q15726	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623		Q8N9W7	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623		J3QLW9	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	AP4M1	O00189	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CCRL2	O00421	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	GABRP	O00591	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	RAMP3	O60896	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ZFPL1	O95159	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CDRT1	O95170	752 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	HCK	P08631	526 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OCM2	P0CE71	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ZNF19	P17023	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	SLC6A1	P30531	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	VHL	P40337	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	RAB7A	P51149	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	SLC35B1	P78383	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	FOXE3	Q13461	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	FHL3	Q13643	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ZNF691	Q5VV52	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	RITA1	Q96K30	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623		A0A1W2PP11	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM13A-217	ENST00000511623	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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