RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2E1	P51965	193 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	DLX6	P56179	175 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	AES	Q08117	197 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ODAM	A1E959	279 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	MGMT	P16455	207 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	HTR2C	P28335	458 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	PAX5	Q02548	391 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	COQ2	Q96H96	371 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148		H3BUX3	64 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	MYL9	P24844	172 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	RANBP1	P43487	201 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	GLIPR1	P48060	266 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148		H3BUI4	141 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SLC22A1	O15245	554 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	CD37	P11049	281 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	PSMD7	P51665	324 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	EFNB2	P52799	333 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM104	Q8NE00	496 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	CORO2A	Q92828	525 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148		Q96M66	194 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	BANF2	Q9H503	90 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148		G3V4G9	280 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SLC17A2	O00624	439 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	PDCD5	O14737	125 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	BPNT1	O95861	308 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	PAH	P00439	452 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	COX7A1	P24310	79 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	NEDD8	Q15843	81 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	LY6E	Q16553	131 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	SSX3	Q99909	188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	KIF25	Q9UIL4	384 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	CHST1	O43916	411 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	MPIG6B	O95866	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	CSF1	P09603	554 aa		13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MIB2-223	ENST00000508148	GLP1R	P43220	463 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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