RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, human

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		J3QT63	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RGS5	O15539	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	AKR7A2	O43488	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	HPGDS	O60760	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CLPX	O76031	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SFTPB	P07988	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CD55	P08174	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	UBB	P0CG47	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NPBWR2	P48146	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	QRFP	P83859	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RSU1	Q15404	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NRGN	Q92686	78 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	S100A13	Q99584	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MMP27	Q9H306	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LIME1	Q9H400	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	BANF2	Q9H503	90 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DSCAM	O60469	2012 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DYSF	O75923	2080 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A0A6YYD4	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		H7C417	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	WNT9B	O14905	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NDUFS7	O75251	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TSPAN9	O75954	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LY6H	O94772	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CYB5A	P00167	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GTF2F2	P13984	249 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MGMT	P16455	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ELK1	P19419	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GLRA1	P23415	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	COL8A2	P25067	703 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CAPZA1	P52907	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ART1	P52961	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GMFB	P60983	142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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