RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 PRRX1P54821 245 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RSU1Q15404 277 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 CCDC58Q4VC31 144 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OR56B4Q8NH76 319 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 MYDGFQ969H8 173 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 TOMM40LQ969M1 308 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 A0A1W2PPE3 182 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OOSP1A8MZH6 123 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 MAGEB3O15480 346 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 OGG1O15527 345 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 DCKP27707 260 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 DDI2Q5TDH0 399 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 DRAM1Q8N682 238 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF485Q8NCK3 441 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 UBALD1Q8TB05 177 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RPEQ96AT9 228 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 SMIM19Q96E16 107 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 RDH12Q96NR8 316 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 IL36GQ9NZH8 169 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 ST3GAL6Q9Y274 331 aa14.65□□□□□ -0.06
CHD1L-209ENST00000492728 IGLL1P15814 213 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ARHGDIBP52566 201 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 OSR2Q8N2R0 312 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 IFT22Q9H7X7 185 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ING4Q9UNL4 249 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 CD2P06729 351 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 SERPINA2P20848 420 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 MNDAP41218 407 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 KCNJ3P48549 501 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 OR52N1Q8NH53 320 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 GHSRQ92847 366 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 METTL9Q9H1A3 318 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 C15orf65H3BRN8 121 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 PIN1P1O15428 100 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 BDKRB2P30411 391 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 PPP3R1P63098 170 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 MADCAM1Q13477 382 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 MRAPQ8TCY5 172 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 CYGBQ8WWM9 190 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 SGCDQ92629 289 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 H3BUI4 141 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 FAM106CPP0CH98 169 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 PF4V1P10720 104 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 CD33P20138 364 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 RIPK1Q13546 671 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 HNF4GQ14541 408 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 REC114Q7Z4M0 266 aa14.61□□□□□ -0.07
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF329Q86UD4 541 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms