RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489977.5

SKAP2-206, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 679 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-206ENST00000489977 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 BBS2Q9BXC9 721 aa1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 MFSD1Q9H3U5 465 aa1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 DSN1Q9H410 356 aa1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 ENPP5Q9UJA9 477 aa1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 SCML1Q9UN30 329 aa1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 GMEB1Q9Y692 573 aa1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 PCNX2A6NKB5 2137 aa1.27□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 STRCP1A6NGW2 1772 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 KIAA0232Q92628 1395 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 MYO9BQ13459 2157 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1W2PNM2 257 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 OR5H14A6NHG9 310 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 H3BMM0 161 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 J3QKU1 62 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 PDCD6O75340 191 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CA2P00918 260 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 GYPCP04921 128 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 GP1BAP07359 652 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 GUSBP08236 651 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 NQO2P16083 231 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 TNNC1P63316 161 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 HBG1P69891 147 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 HBG2P69892 147 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CD164Q04900 197 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CST6Q15828 149 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CLEC6AQ6EIG7 209 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 ERICH5Q6P6B1 374 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 Q8NDZ9 215 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 OR2Y1Q8NGV0 311 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 GPR119Q8TDV5 335 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 UBE2WQ96B02 151 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 B9D2Q9BPU9 175 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 APOL4Q9BPW4 351 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 OR2D2Q9H210 308 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 OR52A5Q9H2C5 316 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 TMEM106BQ9NUM4 274 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 EURLQ9NYK6 297 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 MAT2BQ9NZL9 334 aa1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 ATAD5Q96QE3 1844 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 A0A0B4J2C4 111 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1B0GTI1 187 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 A0A1B0GW15 77 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 MGAT4DA6NG13 374 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 F8VP50 259 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 hCG_2039718K7EN88 272 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 SH2D1AO60880 128 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 SCN2BO60939 215 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 UGT2B11O75310 529 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 TRGV3P03979 118 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 AKR1C4P17516 323 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 TSPOP30536 169 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 HSPA13P48723 471 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 RHOAP61586 193 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 STX3Q13277 289 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CYHR1Q6ZMK1 362 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 TRIML2Q8N7C3 387 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 ZIC4Q8N9L1 334 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 ANGPTL6Q8NI99 470 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 MUC7Q8TAX7 377 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 EBPLQ9BY08 206 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 UGT2B28Q9BY64 529 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 SLC25A31Q9H0C2 315 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 TUBA4BQ9H853 241 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 MS4A12Q9NXJ0 267 aa1.25□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 RAB19A4D1S5 217 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 RBFOX3A6NFN3 312 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 LY6LH3BQJ8 138 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 M0QXV9 152 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 PHYHO14832 338 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 FABP7O15540 132 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 DHRS3O75911 302 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 FADS2O95864 444 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CTSGP08311 255 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 SLC35E2BP0CK96 405 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 PYCR1P32322 319 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 MAGEA6P43360 314 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 OR10A3P58181 314 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 EXOC3L4Q17RC7 722 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CEACAM21Q3KPI0 293 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 C10orf91Q5T1B1 145 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 NXNL2Q5VZ03 156 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 PDPK2PQ6A1A2 396 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 Q6ZT83 130 aa1.24□□□□□ -2.21
SKAP2-206ENST00000489977 CD302Q8IX05 232 aa1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms