RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 TEX36Q5VZQ5 186 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 DEFB108BQ8NET1 73 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SNX22Q96L94 193 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SEC22CQ9BRL7 303 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SHARPINQ9H0F6 387 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 MED28Q9H204 178 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM106BQ9NUM4 274 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM178BH3BS89 294 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 HLA-DRB3P79483 266 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 AESQ08117 197 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 C4orf46Q504U0 113 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 STUMQ69YW2 141 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 MYO18BQ8IUG5 2567 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 OR5H14A6NHG9 310 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 CCNKO75909 580 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 HPXP02790 462 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 FPR2P25090 351 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 FCGR2CP31995 323 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 ECI1P42126 302 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 OR4A4PQ8NGN8 299 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 KIF25Q9UIL4 384 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SNRPGP15A8MWD9 76 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SSNA1O43805 119 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 TK1P04183 234 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 KRBOX4Q5JUW0 171 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF561Q8N587 486 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 COQ2Q96H96 371 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 GPR132Q9UNW8 380 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 TRAV39A0A0B4J263 110 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 A6NNC1 897 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 LGALS8O00214 317 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 BET1O15155 118 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 PAX5Q02548 391 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A42Q86VD7 318 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 CAPSLQ8WWF8 208 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 SDSLQ96GA7 329 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF69Q9UC07 566 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 FLNCQ14315 2725 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 MEIKINA0A087WXM9 373 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 OR4E1P0C645 316 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 PGAM2P15259 253 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 ZNRF1Q8ND25 227 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 LIME1Q9H400 295 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 KCNIP1Q9NZI2 227 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 PPIAL4EA0A075B759 164 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 PPIAL4DF5H284 164 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 K7N7A8 449 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 MGST3O14880 152 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 GYPAP02724 150 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 PPIAL4FP0DN26 164 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 CD300CQ08708 224 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 HFEQ30201 348 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 CD276Q5ZPR3 534 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF626Q68DY1 528 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 C5orf24Q7Z6I8 188 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 RAB1BQ9H0U4 201 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHB10Q9UN67 800 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 PPIAL4AQ9Y536 164 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 MAB21L2Q9Y586 359 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB3-210ENST00000489475 CD8AP01732 235 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 SOD3P08294 240 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 DANCRP0C864 163 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 RNF224P0DH78 156 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 TAS2R31P59538 309 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 BAMBIQ13145 260 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 EDDM3AQ14507 147 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 HERPUD1Q15011 391 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 C11orf71Q6IPW1 123 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 DTX2Q86UW9 622 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 OR52B4Q8NGK2 314 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 OR5D13Q8NGL4 314 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF221Q9UK13 617 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PPR1 153 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 GLIPR1P48060 266 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 FAHD2AQ96GK7 314 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 C5orf66Q9H5L9 145 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 TAF9BQ9HBM6 251 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 AKR1C4P17516 323 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 HERV-K104P61576 105 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 IL1F10Q8WWZ1 152 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 KIRREL1Q96J84 757 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-210ENST00000489475 CCL13Q99616 98 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms