RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 A0A087WV48 116 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CCSO14618 274 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SIX6O95475 246 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 AADACP22760 399 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 AVPI1Q5T686 147 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF524Q96C55 264 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0A6YYJ9 748 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 PPYP01298 95 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 IFNA1P01562 189 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM131Q92545 1883 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PDGFAP04085 211 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 BRS3P32247 399 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CAMLGP49069 296 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF626Q68DY1 528 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF714Q96N38 554 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GVG6 124 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 OMGP23515 440 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf50Q96LR7 162 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ROS1P08922 2347 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FCGR3BO75015 233 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 WISP1O95388 367 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 HLA-DQB1P01920 261 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SSX4O60224 188 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 B3GALNT1O75752 331 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SPDEFO95238 335 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 RAB13P51153 203 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 GNB1P62873 340 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 HIST1H3AP68431 136 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 AKR1C1Q04828 323 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 IL36GQ9NZH8 169 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 NCOR2Q9Y618 2525 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 ODAMA1E959 279 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRD-211ENST00000486161 KRASP01116 189 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 COX5AP20674 150 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PSMB6P28072 239 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 WNT5AP41221 380 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF266Q14584 549 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF79Q15937 498 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.06□□□□□ -1.28
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