RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM46BQ96A09 425 aa14.77□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.77□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.77□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ATRQ13535 2644 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 NOTOA8MTQ0 251 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 AIPO00170 330 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 PDCD6O75340 191 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 MT-ND4P03905 459 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 OR10A3P58181 314 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 KLRD1Q13241 179 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 P2RY14Q15391 338 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 BRICD5Q6PL45 260 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 Q6YL49 198 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 RAB22AQ9UL26 194 aa14.76□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CLDN34H7C241 214 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CLPXO76031 633 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CHATP28329 748 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM189A2Q15884 450 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 HES5Q5TA89 166 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 PTX4Q96A99 478 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ING3Q9NXR8 418 aa14.75□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TRIM77I1YAP6 450 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM127O75204 238 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 SMIM18P0DKX4 95 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CDK2P24941 298 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CD34P28906 385 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 SDC2P34741 201 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 SAA4P35542 130 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CLDN12P56749 244 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 BAMBIQ13145 260 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 PNKDQ8N490 385 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 NEK7Q8TDX7 302 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CENPOQ9BU64 300 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ESM1Q9NQ30 184 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ETAA1Q9NY74 926 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 HSF4Q9ULV5 492 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A087X0M5 115 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A0U1RQK1 487 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A1B0GX30 115 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 MEIOCA2RUB1 952 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ORC5O43913 435 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 AIREO43918 545 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 MMP23AO75900 390 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 FBP1P09467 338 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 RAB6AP20340 208 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF626Q68DY1 528 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM86BQ8N661 226 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 AJUBAQ96IF1 538 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 KCNK15Q9H427 330 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CALYQ9NYX4 217 aa14.73□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A0A6YYD4 124 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ODF3BA8MYP8 253 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 LGALS4P56470 323 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TMEM50BP56557 158 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 MALSU1Q96EH3 234 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 NICN1Q9BSH3 213 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.72□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.71□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A1W2PRD5 423 aa14.71□□□□□ -0.05
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A1W2PRF3 423 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms