RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 RFKQ969G6 155 aa7.4□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-210ENST00000481231 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.4□□□□□ -1.22
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SMARCE1-210ENST00000481231 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMARCE1-210ENST00000481231 MOB3BQ86TA1 216 aa7.37□□□□□ -1.23
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SMARCE1-210ENST00000481231 RNF152Q8N8N0 203 aa7.37□□□□□ -1.23
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SMARCE1-210ENST00000481231 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 C4orf36Q96KX1 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SCOCQ9UIL1 159 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 AP4S1Q9Y587 144 aa7.37□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.36□□□□□ -1.23
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