RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 A0A087X0M5 115 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 A0A1B0GX30 115 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 MCRIP1C9JLW8 97 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 BPNT1O95861 308 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 GALP22466 123 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 CDK2P24941 298 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 HTR1DP28221 377 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 GABRA5P31644 462 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 DYNLT3P51808 116 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 DLX1P56177 255 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 C1orf100Q5SVJ3 147 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 SUMF2Q8NBJ7 301 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 FCGR1BQ92637 280 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 ZNF747Q9BV97 191 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 ABCB10Q9NRK6 738 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 LRRC42Q9Y546 428 aa10.84□□□□□ -0.67
PRAME-211ENST00000476336 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MAGEA13PA6NCF6 341 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TOR1AO14656 332 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CD37P11049 281 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MGMTP16455 207 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RAG2P55895 527 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TAF9Q16594 264 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TMEM30BQ3MIR4 351 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ATAD3CQ5T2N8 411 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ABHD12Q8N2K0 398 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OR6M1Q8NGM8 313 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 NEK7Q8TDX7 302 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 SGCDQ92629 289 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TNFRSF19Q9NS68 423 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 C1RLQ9NZP8 487 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 KIF25Q9UIL4 384 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 LEUTXA8MZ59 168 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OOSP1A8MZH6 123 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 H3BUX3 64 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 HSPB6O14558 160 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ORC5O43913 435 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CGB3P0DN86 165 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CGB7P0DN87 165 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 FUT3P21217 361 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 HTR2CP28335 458 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 GLP1RP43220 463 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 FAM189A2Q15884 450 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 C11orf88Q6PI97 169 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 LRRTM1Q86UE6 522 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OR9G1Q8NH87 305 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TMEM203Q969S6 136 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 AJUBAQ96IF1 538 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 Q96M66 194 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 SELENOIQ9C0D9 397 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CALYQ9NYX4 217 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 DPM3Q9P2X0 92 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PDCD5O14737 125 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 TSPAN9O75954 239 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 IL1AP01583 271 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 BRS3P32247 399 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 SSX2Q16385 188 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 Q3ZCU0 254 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RAB12Q6IQ22 244 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 OR52M1Q8NGK5 317 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 NDNFQ8TB73 568 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 KIRREL1Q96J84 757 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 C16orf95Q9H693 158 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 NDUFB11Q9NX14 153 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 ING3Q9NXR8 418 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 CCRL2O00421 344 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 SLC22A1O15245 554 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 IGLV1-47P01700 117 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MNDAP41218 407 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 MAP2K4P45985 399 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 RPS25P62851 125 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 INSL4Q14641 139 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 C17orf58Q2M2W7 97 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAME-211ENST00000476336 C6orf183Q5T699 404 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms