RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 LYNX1P0DP58 116 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 AADACL3Q5VUY0 350 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 DTX2Q86UW9 622 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 LHFPL1Q86WI0 220 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM17Q86X19 198 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 C1orf87Q8N0U7 546 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 OR6F1Q8NGZ6 308 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 MARCH1Q8TCQ1 289 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 DUX4Q9UBX2 424 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 KIF25Q9UIL4 384 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 H7C1Q1 480 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 VSIG10L2P0DP72 767 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 SELLP14151 372 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 COL8A2P25067 703 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 SNX22Q96L94 193 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 CCL13Q99616 98 aa22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HOXB3-207ENST00000472863 OR5H14A6NHG9 310 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 GLIPR1P48060 266 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 MECP2P51608 486 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 HERPUD1Q15011 391 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 SLC35E4Q6ICL7 350 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TMED4Q7Z7H5 227 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 NEURL2Q9BR09 285 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 GHITMQ9H3K2 345 aa22.95■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TANC2Q9HCD6 1990 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 PPIAL4EA0A075B759 164 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 PPIAL4DF5H284 164 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 LGALS8O00214 317 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 PPIAL4FP0DN26 164 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 KIR2DS4P43632 304 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 KCNJ3P48549 501 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 KIR2DS1Q14954 304 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 KRBOX4Q5JUW0 171 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 DHRS11Q6UWP2 260 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 PPIAL4AQ9Y536 164 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 C7orf66A4D0T2 115 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 K7N7A8 449 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 CBX3Q13185 183 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 EDDM3AQ14507 147 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 CAPSLQ8WWF8 208 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 SDSLQ96GA7 329 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 GAFA1Q96PS6 74 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 SEC22CQ9BRL7 303 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 MEIKINA0A087WXM9 373 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 BET1O15155 118 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 FCGR2CP31995 323 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 CD300CQ08708 224 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 HFEQ30201 348 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF788Q6ZQV5 615 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF561Q8N587 486 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 RAB1BQ9H0U4 201 aa22.93■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 LY6HO94772 140 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TK1P04183 234 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 HLA-DRB3P79483 266 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 PRR18Q8N4B5 295 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 UBALD1Q8TB05 177 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF221Q9UK13 617 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 POM121CA8CG34 1229 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 BAMBIQ13145 260 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 FAM216BQ8N7L0 139 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 ZDHHC22Q8N966 263 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 SPOCK3Q9BQ16 436 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.92■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 OR52B4Q8NGK2 314 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 PPP1R35Q8TAP8 253 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 KIRREL1Q96J84 757 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 DCTN5Q9BTE1 182 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 MGST3O14880 152 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 MOB1BQ7L9L4 216 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 OR51J1Q9H342 316 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TAF9BQ9HBM6 251 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 GPR132Q9UNW8 380 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 CEACAM18A8MTB9 384 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TMPRSS2O15393 492 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 PRAF2O60831 178 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 PI3P19957 117 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM185AQ8NFB2 350 aa22.9■■□□□ 1.26
HOXB3-207ENST00000472863 OR4A4PQ8NGN8 299 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms