RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CALY	Q9NYX4	217 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CD1A	P06126	327 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MAP2K4	P45985	399 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	KCNJ3	P48549	501 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	PRRX1	P54821	245 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880		H3BUI4	141 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	PEX14	O75381	377 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MGMT	P16455	207 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CRHBP	P24387	322 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SSTR5	P35346	364 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CEACAM3	P40198	252 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	VHL	P40337	213 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	AANAT	Q16613	207 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	AIP	O00170	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CHST1	O43916	411 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	MPIG6B	O95866	241 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	IL1A	P01583	271 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CD24	P25063	80 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	IRF3	Q14653	427 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		Q8NFD4	153 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CST11	Q9H112	138 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP21	Q9H596	190 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RAB26	Q9ULW5	256 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN9	O75954	239 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	BRS3	P32247	399 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		Q9H521	79 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf95	Q9H693	158 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPE3	182 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	SRM	P19623	302 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	MNDA	P41218	407 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	PROK1	P58294	105 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	TRAM1	Q15629	374 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	UTF1	Q5T230	341 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SSR4-208	ENST00000471880	RPE	Q96AT9	228 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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