RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PDCD1Q15116 288 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 MCEMP1Q8IX19 187 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 MDS2Q8NDY4 140 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 KPTNQ9Y664 436 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 FAM166BA8MTA8 275 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 ZNF205O95201 554 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 CCNOP22674 350 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 IL24Q13007 206 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 KIRREL1Q96J84 757 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 HES7Q9BYE0 225 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 SFTA3P0C7M3 94 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 UCP1P25874 307 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 PAX6P26367 422 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D26Q86UD7 250 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 BOD1Q96IK1 185 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 SMIM3Q9BZL3 60 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 TMEM231Q9H6L2 316 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-205ENST00000409985 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 NDUFA2O43678 99 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 LMO1P25800 156 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 APLNRP35414 380 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 GNG3P63215 75 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ZNF880Q6PDB4 577 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ZNF695Q8IW36 515 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 WFDC1Q9HC57 220 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 FAM96BQ9Y3D0 163 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN15O95858 294 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SNCAP37840 140 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 RFC3P40938 356 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 PEA15Q15121 130 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 OR2C3Q8N628 320 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A31Q9H0C2 315 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GW64 132 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A20A6NK97 555 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 MEOX1P50221 254 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ZNF266Q14584 549 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SLC10A1Q14973 349 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 C9orf135Q5VTT2 229 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 CMTM1Q8IZ96 169 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SMDT1Q9H4I9 107 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 CACFD1Q9UGQ2 172 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 C1QTNF9P0C862 333 aa20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 NPBWR1P48145 328 aa20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 OR1K1Q8NGR3 316 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 TREM2Q9NZC2 230 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 CRIM1Q9NZV1 1036 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 DKK4Q9UBT3 224 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 LHX6Q9UPM6 363 aa20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 NKX2-6A6NCS4 301 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 H0Y980 276 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 NGFP01138 241 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SCTP09683 121 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 CD80P33681 288 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 OR8U9P0C7N5 309 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SLC25A6P12236 298 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 CCL2P13500 99 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 CD46P15529 392 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 NMSQ5H8A3 153 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 LINC00696Q6ZRV3 163 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 OR10Z1Q8NGY1 313 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 OR8U1Q8NH10 309 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SECTM1Q8WVN6 248 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 MED13Q9UHV7 2174 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 NKX2-8O15522 239 aa20.28■□□□□ 0.84
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