RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 A0A096LPE4 126 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 A0A1W2PPZ6 126 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 K7EM74 188 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 SOD3P08294 240 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 GLRA1P23415 457 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 UBE2V2Q15819 145 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ERGIC1Q969X5 290 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 WDYHV1Q96HA8 205 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 NICN1Q9BSH3 213 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.02■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR5H1A6NKK0 313 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 SYNGR3O43761 229 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CEACAM6P40199 344 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 FHITP49789 147 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PSG4Q00888 419 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ELOBQ15370 118 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 SPACA3Q8IXA5 215 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 Q8WTZ3 238 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CRYGSP22914 178 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CTSSP25774 331 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CRIP3Q6Q6R5 217 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR5AS1Q8N127 324 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MISP3Q96FF7 219 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PRO1933Q9H354 126 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa16.01■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 A0A0A6YYD4 124 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 M0R135 149 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 IGLV3-1P01715 115 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CXCL1P09341 107 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 P2RY1P47900 373 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 GRB2P62993 217 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 HIKESHIQ53FT3 197 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PLAC9Q5JTB6 97 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR5R1Q8NH85 324 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF799Q96GE5 643 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PGAM5Q96HS1 289 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 WNT5BQ9H1J7 359 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PRR14LQ5THK1 2151 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PRH1P02810 166 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 GFI1BQ5VTD9 330 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 TMEM104Q8NE00 496 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 NPRL2Q8WTW4 380 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 TAAR6Q96RI8 345 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 C12orf49Q9H741 205 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MSRB2Q9Y3D2 182 aa16■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF727A8MUV8 499 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 TCAPO15273 167 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 AMY2BP19961 511 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 TMEM45BQ96B21 275 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 WFDC1Q9HC57 220 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PRSS50Q9UI38 385 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CCL1P22362 96 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR3A2P47893 321 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 RAB39BQ96DA2 213 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.99■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 IGF2RP11717 2491 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 E5RGE8 158 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 H3BQ15 152 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 SOCS1O15524 211 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CST2P09228 141 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 CCL2P13500 99 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 FAHP16930 419 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 PTGER4P35408 488 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 MOB1AQ9H8S9 216 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 NSG2Q9Y328 171 aa15.98■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 A0A1W2PP11 408 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 RAD51DO75771 328 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 C1QL1O75973 258 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 IFNA21P01568 189 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 OR2H1Q9GZK4 316 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 IGHG3P01860 377 aa15.97■□□□□ 0.15
SNX11-201ENST00000359238 FABP4P15090 132 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms