RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 IL23AQ9NPF7 189 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CREBBPQ92793 2442 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ACACAQ13085 2346 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RAB29O14966 203 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LEPROTL1O95214 131 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ACRP10323 421 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 B3GALT4O96024 378 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TCF23Q7RTU1 214 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 KMT5CQ86Y97 462 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CLN8Q9UBY8 286 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CCL5P13501 91 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 DAOP14920 347 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MYOGP15173 224 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 KCNAB1Q14722 419 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.31□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 UPK1AO00322 258 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SOD3P08294 240 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PRDX4Q13162 271 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SPINK4O60575 86 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 DEFB119Q8N690 84 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RARRES2Q99969 163 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SSX8Q7RTT4 187 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 VENTXO95231 258 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RBP4P02753 201 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 UQCRFS1P47985 274 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 IRF3Q14653 427 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OOEPA6NGQ2 149 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 B4E171 279 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TEPPQ6URK8 271 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MFAP2P55001 183 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF141Q15928 474 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 AQP10Q96PS8 301 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CAPZBP47756 277 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 GNG10P50151 68 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PRRX1P54821 245 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TSC2P49815 1807 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 EPPINO95925 133 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 HES3Q5TGS1 186 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SIPA1L1O43166 1804 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 A0A087WWC5 75 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SLURP2P0DP57 97 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ALG14Q96F25 216 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.3□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 CSN3P07498 182 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 B4GALT1P15291 398 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 GPR3P46089 330 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 GAB4Q2WGN9 574 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 DEFB133Q30KQ1 61 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 LYPD8Q6UX82 237 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 TOX2Q96NM4 488 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 ASB1Q9Y576 335 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 HLA-DQB1P01920 261 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SP6Q3SY56 376 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 RND1Q92730 232 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OGG1O15527 345 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 GJB3O75712 270 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PPP1R17O96001 155 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 MICBQ29980 383 aa7.29□□□□□ -1.24
PKHD1-201ENST00000340994 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.29□□□□□ -1.24
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