RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 C17orf51A8MQB3 221 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 CDK2AP1O14519 115 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 RBP4P02753 201 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 NPVFQ9HCQ7 196 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM11P17152 192 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 OR6X1Q8NH79 312 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRB-202ENST00000334414 DERL1Q9BUN8 251 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-202ENST00000334414 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.87□□□□□ -1.63
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