RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL3P20749 454 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 ZP3P21754 424 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 GNB1P62873 340 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RNLSQ5VYX0 342 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CPOQ8IVL8 374 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CST11Q9H112 138 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 GNB4Q9HAV0 340 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1456Q9P272 454 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 DHDHQ9UQ10 334 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.08□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 SHISA3A0PJX4 238 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 TPPPO94811 219 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV1-51P01701 117 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B1P14061 328 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF20P17024 532 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 GZMHP20718 246 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL1P22362 96 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 GDNFP39905 211 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 NPBWR2P48146 333 aa6.07□□□□□ -1.44
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PGGT1B-201ENST00000296642 GINS1Q14691 196 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 MMDQ15546 238 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2V2Q15819 145 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 LTC4SQ16873 150 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 Q3ZCU0 254 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZSR3 168 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 HDXQ7Z353 690 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N1Y9 231 aa6.07□□□□□ -1.44
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PGGT1B-201ENST00000296642 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.07□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.07□□□□□ -1.44
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PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.07□□□□□ -1.44
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PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf65A6NEN9 183 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 APOL3O95236 402 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV1-40P01703 118 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-7P01780 117 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR1FP30939 366 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 REG1BP48304 166 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCR4P61073 352 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB40BQ12829 278 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATS1Q496A3 300 aa6.06□□□□□ -1.44
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PGGT1B-201ENST00000296642 Q8N402 240 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00311Q8N616 119 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 GIPC3Q8TF64 312 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 LEAP2Q969E1 77 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 OPALINQ96PE5 141 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 MBOAT4Q96T53 435 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.05□□□□□ -1.44
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