RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 AMELYQ99218 206 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 C5orf49A4QMS7 147 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 XRCC2O43543 280 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 HLA-HP01893 362 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM87AP0C7U9 286 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ALDH3B1P43353 468 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 RAB7AP51149 207 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 BORCS8Q96FH0 119 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.69□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 A0A1B0GV50 99 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 A0A1W2PN81 502 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 K7EPK0 472 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 CD74P04233 296 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC25A4P12235 298 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 MPZP25189 248 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 CHRNA7P36544 502 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 DERL3Q96Q80 235 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 PATE4P0C8F1 98 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 PTHLHP12272 177 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 GABRR1P24046 479 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 CHRNB4P30926 498 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 OPRM1P35372 400 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 CAMLGP49069 296 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 NRN1LQ496H8 165 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 FDX2Q6P4F2 183 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF627Q7L945 461 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM18Q96B42 140 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ADAMTS20P59510 1910 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 USP34Q70CQ2 3546 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 TRGC1P0CF51 173 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 GZMBP10144 247 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 GCH1P30793 250 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 THBS2P35442 1172 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 OR3A2P47893 321 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 KLRB1Q12918 225 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 AWAT2Q6E213 333 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 LRP11Q86VZ4 500 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 PIGCQ92535 297 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 RNF2Q99496 336 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 CST11Q9H112 138 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 NGBQ9NPG2 151 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 FREM3P0C091 2139 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.68□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 TRDCB7Z8K6 153 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 XRCC3O43542 346 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 LYZL6O75951 148 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM225BP0DP42 221 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 TAS2R19P59542 299 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 REEP6Q96HR9 211 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 IFITM5A6NNB3 132 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 IRF2P14316 349 aa6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SLC13A3-202ENST00000290317 HIST3H3Q16695 136 aa6.67□□□□□ -1.34
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