RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 OIT3Q8WWZ8 545 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TCFL5Q9UL49 500 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 AMDHD2Q9Y303 409 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 CD1BP29016 333 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 WNT3P56703 355 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TMEM140Q9NV12 185 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 LYZL6O75951 148 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 UQCRFS1P47985 274 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SKP2Q13309 424 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 CD300LDQ6UXZ3 194 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 DTD1Q8TEA8 209 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TBX15Q96SF7 602 aa10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 FXYD1O00168 92 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 FAM157CP0CG43 387 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 CCR2P41597 374 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TCL1AP56279 114 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TCTAP57738 103 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 STPG2Q8N412 459 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 OR6X1Q8NH79 312 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 OR4C12Q96R67 309 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 LRRC61Q9BV99 259 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 GLRX2Q9NS18 164 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 FUT9Q9Y231 359 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 THADAQ6YHU6 1953 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SNURFLB1AK76 121 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ERASQ7Z444 233 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 RAB37Q96AX2 223 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ABHD1Q96SE0 405 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 LAMB2P55268 1798 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 IGSF11Q5DX21 431 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TSPAN32Q96QS1 320 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 MIOXQ9UGB7 285 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 PRNDQ9UKY0 176 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SHISA8B8ZZ34 492 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 COL19A1Q14993 1142 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 RAC3P60763 192 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 GABRA6Q16445 453 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 OR8B3Q8NGG8 313 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 OR8B2Q96RD0 313 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 IFITM10A6NMD0 228 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 IGHV3-43DP0DP04 118 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 GZMHP20718 246 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.1□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ZNF117Q03924 483 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 XAF1Q6GPH4 301 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 CXCL16Q9H2A7 254 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 RPL34P49207 117 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 FZD5Q13467 585 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TWIST1Q15672 202 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ISOC2Q96AB3 205 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ZFP64Q9NPA5 681 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 IL17BQ9UHF5 180 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 OR2W5A6NFC9 320 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ID1P41134 155 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 TEPPQ6URK8 271 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 OR4D9Q8NGE8 314 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SAP30LQ9HAJ7 183 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 PRDM7Q9NQW5 492 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 BCORQ6W2J9 1755 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 RNF224P0DH78 156 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 SRD5A2P31213 254 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 LSM6P62312 80 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ACER2Q5QJU3 275 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 NCMAPQ5T1S8 102 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 ZNF738Q8NE65 137 aa10.09□□□□□ -0.79
THBS1-201ENST00000260356 CADM4Q8NFZ8 388 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms