RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 LDLRAD3Q86YD5 345 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OR11H6Q8NGC7 330 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TM2D1Q9BX74 207 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CST11Q9H112 138 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 LINC00574Q9H8X3 128 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 SESN1Q9Y6P5 492 aa18.12■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WXM4 84 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MEIKINA0A087WXM9 373 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 A0A0A6YYD4 124 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TRAV39A0A0B4J263 110 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TRIM77I1YAP6 450 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CLPXO76031 633 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CFPP27918 469 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CLDN12P56749 244 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 GAPTQ8N292 157 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 KCNG3Q8TAE7 436 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 DYRK2Q92630 601 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC16Q969W1 377 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 NICN1Q9BSH3 213 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OR6C3Q9NZP0 311 aa18.11■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 LDLRAD4O15165 306 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MT-ND4P03905 459 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FUT3P21217 361 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OMGP23515 440 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CDK2P24941 298 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 IER3P46695 156 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G7Q13093 441 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ZNF626Q68DY1 528 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 RAB12Q6IQ22 244 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ZNF497Q6ZNH5 498 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OR51D1Q8NGF3 324 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 LPAR5Q9H1C0 372 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TMEM133Q9H2Q1 129 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 PLGRKTQ9HBL7 147 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 SPACA1Q9HBV2 294 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ZNRD1Q9P1U0 126 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 PEX16Q9Y5Y5 336 aa18.1■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ARSBP15848 533 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CD36P16671 472 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 GADD45AP24522 165 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 PAX6P26367 422 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 PSMD7P51665 324 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 RAB11BQ15907 218 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 C2orf76Q3KRA6 126 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 HES5Q5TA89 166 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 RTN4RL2Q86UN3 420 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 DYNAPQ8N1N2 210 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM89BQ8N5H3 189 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 ZNF565Q8N9K5 539 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OR13D1Q8NGV5 346 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MRGPRDQ8TDS7 321 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM3DQ96BQ1 224 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 TMEM59Q9BXS4 323 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MEGF9Q9H1U4 602 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 RNF167Q9H6Y7 350 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FBLN5Q9UBX5 448 aa18.09■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 MCRIP1C9JLW8 97 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 PDCD5O14737 125 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 PDCD6O75340 191 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-59P01825 116 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 GLAP06280 429 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CHATP28329 748 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 OR2W3Q7Z3T1 314 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 CALYQ9NYX4 217 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 STEAP1Q9UHE8 339 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 SSR3Q9UNL2 185 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 FAM96BQ9Y3D0 163 aa18.08■□□□□ 0.49
SYF2-201ENST00000236273 A0A087X0M5 115 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GX30 115 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 IFITM5A6NNB3 132 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 C15orf65H3BRN8 121 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 FBP1P09467 338 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 RAB3BP20337 219 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 MYL9P24844 172 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 CD34P28906 385 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 GLP1RP43220 463 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TMEM86BQ8N661 226 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 BEND2Q8NDZ0 799 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 YIPF6Q96EC8 236 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 KIRREL1Q96J84 757 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 STAB1Q9NY15 2570 aa18.07■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 UBE2QL1A1L167 161 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 IL1AP01583 271 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 ARG1P05089 322 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 ABHD12Q8N2K0 398 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 RFESDQ8TAC1 157 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 CCDC107Q8WV48 283 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms