RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cst6Q9D1B1 149 aa10.11□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Clic3Q9D7P7 237 aa10.11□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cldn12Q9ET43 244 aa10.11□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Klk1b27Q9JM71 263 aa10.11□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Naa10Q9QY36 235 aa10.11□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 A0A1Y7VJH8 109 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm364A2AFI6 671 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnf217D3YYI7 515 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr39E9PVX1 319 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1510E9PZZ6 318 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr171G5E8J1 314 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Galr2O88854 371 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rps2P25444 293 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Htr5aP30966 357 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gsx1P31315 261 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Etv1P41164 477 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pitx2P97474 317 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10384Q3UQ87 92 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp30Q60585 533 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PnlipQ6P8U6 465 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gpr173Q6PI62 373 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fbxo2Q80UW2 297 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mgat4aQ812G0 535 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc30a8Q8BGG0 367 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LsampQ8BLK3 341 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Orai1Q8BWG9 304 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PiguQ8K358 434 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Eps8l3Q91WL0 600 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem246Q91YV9 403 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdr77Q99J09 342 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnajb11Q99KV1 358 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Raf1Q99N57 648 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mrps36Q9CQX8 102 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sgo1Q9CXH7 517 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wdr20Q9D5R2 567 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 IckQ9JKV2 629 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnaja4Q9JMC3 397 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CompQ9R0G6 755 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Deaf1Q9Z1T5 566 aa10.1□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Setd2E9Q5F9 2537 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr465-ps1A0A0U1RPZ4 315 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fbxw28E9Q8A4 466 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pwwp2bE9Q9M8 600 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm379J3QQ19 296 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hsd17b12O70503 312 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 P01803 113 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cryba1P02525 198 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Muc13P19467 573 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wnt2P21552 360 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 H2-DMaP28078 261 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Clec3bP43025 202 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gal3st2cQ3ULK5 396 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 B020031M17RikQ3UT11 173 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Them4Q3UUI3 230 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bod1Q5SQY2 173 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PnkdQ69ZP3 385 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bnip1Q6QD59 228 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1474Q7TQQ8 314 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr198Q7TS40 306 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 IfnkQ7TSL0 199 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bricd5Q8BV89 174 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc25a41Q8BVN7 312 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vash1Q8C1W1 375 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Teddm1bQ8CC62 306 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mr1Q8HWB0 341 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mapre2Q8R001 326 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rdh10Q8VCH7 341 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1184Q8VG86 311 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 PnpoQ91XF0 261 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr116Q923Q6 321 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sft2d3Q9CSV6 209 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hnrnpa0Q9CX86 305 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Exosc8Q9D753 276 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccdc54Q9DAL3 329 aa10.09□□□□□ -0.79
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ighv1-37A0A0A6YW32 117 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm13762A2ATG2 311 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 RnlsA7RDN6 342 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp563B8JJZ9 448 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ogg1O08760 345 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccl20O89093 97 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mtnd4lP03903 98 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 LplP11152 474 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Myf6P15375 242 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 KitlgP20826 273 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem14aP56983 99 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fkbp14P59024 211 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sec61a1P61620 476 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 HfeP70387 359 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Npy6rQ61212 371 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zfp955aQ80XR7 545 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm26558Q8BLW8 286 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gper1Q8BMP4 375 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kctd20Q8CDD8 419 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pafah2Q8VDG7 390 aa10.08□□□□□ -0.8
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem144Q8VEH0 348 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.8 ms