RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	BIN3	Q9NQY0	253 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	STARD10	Q9Y365	291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ESPL1	Q14674	2120 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	USP24	Q9UPU5	2620 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	MSGN1	A6NI15	193 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	HTR3B	O95264	441 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	NAT2	P11245	290 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PI3	P19957	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	AKR1C2	P52895	323 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	AKR1C1	Q04828	323 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	KISS1	Q15726	138 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	S100A13	Q99584	98 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TM2D1	Q9BX74	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ZFP57	Q9NU63	452 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV3-15	P01624	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB32	Q13637	225 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR10C1	Q96KK4	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	IFT22	Q9H7X7	185 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR173	Q9NS66	373 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5H1	A6NKK0	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	GLRA1	P23415	457 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CPT2	P23786	658 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OPRM1	P35372	400 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	IL15RA	Q13261	267 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PIGT	Q969N2	578 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SMIM8	Q96KF7	97 aa		12.79	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	MSTN	O14793	375 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	IFNA2	P01563	188 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CBR1	P16152	277 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	NPBWR1	P48145	328 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	S100A10	P60903	97 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	MALL	Q13021	153 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PCSK4	Q6UW60	755 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	C12orf57	Q99622	126 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	PRR13	Q9NZ81	148 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481		A8MXE2	369 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	IFNA4	P05014	189 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM42	Q69YG0	159 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	S100PBP	Q96BU1	408 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	MICU1	Q9BPX6	476 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	CDH20	Q9HBT6	801 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SPIN3-208	ENST00000638481	SFTPB	P07988	381 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	HOXB5	P09067	269 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	SERPINA2	P20848	420 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	PAX6	P26367	422 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	CAV2	P51636	162 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	SMCO1	Q147U7	214 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	OR51F2	Q8NH61	342 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	RHOF	Q9HBH0	211 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	SMPD2	O60906	423 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	NRAS	P01111	189 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	CECR9	P0C854	216 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	FOLR2	P14207	255 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	AKR1D1	P51857	326 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM27E3	Q08E93	113 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	AVPI1	Q5T686	147 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SPIN3-208	ENST00000638481	PLCE1	Q9P212	2302 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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