RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RARRES3	Q9UL19	164 aa		3.95	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC16A	O15027	2179 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CLDN24	A6NM45	220 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	C4orf51	C9J302	202 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		E9PLD3	99 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		K7ENP7	123 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PFDN1	O60925	122 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC6A	O75865	159 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GABARAP	O95166	117 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CLDN1	O95832	211 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HCK	P08631	526 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CD36	P16671	472 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-DMA	P28067	261 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRA4	P48169	554 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	UGT2B15	P54855	530 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP6	Q13520	282 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FHL1	Q13642	323 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM53B	Q14153	422 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SPCS2	Q15005	226 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB134	Q4QY38	66 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF738	Q8NE65	137 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB124	Q8NES8	71 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF675	Q8TD23	568 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	S100Z	Q8WXG8	99 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR7D2	Q96RA2	312 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MICU1	Q9BPX6	476 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	WAC	Q9BTA9	647 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PRELID1	Q9Y255	219 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		3.94	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WW49	117 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GTI1	187 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CLDN25	C9JDP6	229 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		H0YGG7	62 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		K7EMT4	169 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZZEF1	O43149	2961 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ENTPD6	O75354	484 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC2A5	P22732	501 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	THBS3	P49746	956 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GPM6A	P51674	278 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R41	P59536	307 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	VBP1	P61758	197 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GINS1	Q14691	196 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF846	Q147U1	533 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NEUROG1	Q92886	237 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RARRES2	Q99969	163 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DDA1	Q9BW61	102 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		Q9UF83	564 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA2	Q9UM82	520 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAP13	Q12802	2813 aa		3.92	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms