RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS35Q8N3Z0 413 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST4Q8NCG5 386 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10H4Q8NGA5 316 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 OPALINQ96PE5 141 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CALYQ9NYX4 217 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 AQP12BA6NM10 295 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01548A6NM66 108 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPB6O14558 160 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DEGS1O15121 323 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF260Q3ZCT1 412 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM220AQ7Z4H9 259 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 AQP12AQ8IXF9 295 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8H3Q8N146 312 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 FGGYQ96C11 551 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 RCHY1Q96PM5 261 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SPACA5Q96QH8 159 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT84Q9NSB2 600 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM4BO94953 1096 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR50Q13585 617 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DOC2BQ14184 412 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DS1Q14954 304 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10X1Q8NGY0 326 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SPSB1Q96BD6 273 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GON7Q9BXV9 100 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GNG8Q9UK08 70 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG11Q9UQ72 335 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TENM2Q9NT68 2774 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 MEIKINA0A087WXM9 373 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT1C4O75897 302 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T7P0C7T2 308 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 LYL1P12980 280 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1E1P36543 226 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR3DL2P43630 455 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR12P47775 334 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 UTS2BQ765I0 119 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 MOB3BQ86TA1 216 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA24Q86W54 205 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF565Q8N9K5 539 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SCOCQ9UIL1 159 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP6O75344 327 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DAPP51397 102 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM244Q5VVB8 128 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6P435 159 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13A1Q8NGR1 328 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF25Q9UIL4 384 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 GNGT1P63211 74 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXE3Q13461 319 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TP53I3Q53FA7 332 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 FAHD1Q6P587 224 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RFESDQ8TAC1 157 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 THTPAQ9BU02 230 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B6O14756 317 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MITFO75030 526 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 IL1AP01583 271 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 REG1BP48304 166 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13C9Q8NGT0 318 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SACSQ9NZJ4 4579 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPE3 182 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YJX3 145 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ELANEP08246 267 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CALB2P22676 271 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf73Q69YU5 71 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 NRBF2Q96F24 287 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCG5Q9H222 651 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOFQ9HBH0 211 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CCRL2O00421 344 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM225BP0DP42 221 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SBSPONQ8IVN8 264 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGPRDQ8TDS7 321 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf3Q8WVX3 66 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPL10Q9BXB5 764 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE6AA0A183 80 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ZAR1LA6NP61 321 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MPZL2O60487 215 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CGB3P0DN86 165 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CGB7P0DN87 165 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 VDAC1P21796 283 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHA2P29317 976 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR1FP30939 366 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-217ENST00000629983 EFNB1P98172 346 aa21.41■■□□□ 1.02
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