RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	AQP2	P41181	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	OR3A3	P47888	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP1B3	P54709	279 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RX3	P56373	397 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PRDX4	Q13162	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SNCB	Q16143	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	AQP3	Q92482	292 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0B4J2E0	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1B0GX12	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		H7C1C5	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SIVA1	O15304	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PIAS1	O75925	651 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYGA	P11844	174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GABRR1	P24046	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LCN6	P62502	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MT1H	P80294	61 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM3A	P98173	230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA0040	Q15053	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	STH	Q8IWL8	128 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51I2	Q9H344	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PS18	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		F5H768	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TUSC2	O75896	110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2C1	O95371	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	SPP1	P10451	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	C4BPB	P20851	252 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	FMO3	P31513	532 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PYCR1	P32322	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	GNG3	P63215	75 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PLGLA	Q15195	96 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0D9SG52	128 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NIZ1	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MGST3	O14880	152 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	IL3RA	P26951	378 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEA2	P43356	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1E2	P47887	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	CDH12	P55289	794 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RAP1B	P61224	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RAP1A	P62834	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76

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