RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK5	Q00535	292 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	PAX5	Q02548	391 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	LTB	Q06643	244 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00471	Q8N535	108 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TSSK2	Q96PF2	358 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	PHB2	Q99623	299 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SYT3	Q9BQG1	590 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF24	Q9Y225	148 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	UMAD1	C9J7I0	102 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	DCTN6	O00399	190 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	GYPB	P06028	91 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CSF1	P09603	554 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	MAK	P20794	623 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	NTF4	P34130	210 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TAS2R43	P59537	309 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RAC3	P60763	192 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	FMOD	Q06828	376 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	APH1A	Q96BI3	265 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF649	Q9BS31	505 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	NCKAP5	O14513	1909 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	GOSR1	O95249	250 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	GPANK1	O95872	356 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	AMBP	P02760	352 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL2	P13500	99 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC2A5	P22732	501 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRNB4	P30926	498 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CDA	P32320	146 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	DCTD	P32321	178 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	PTH2R	P49190	550 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SULT1A2	P50226	295 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB7A	P51149	207 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CTXN1	P60606	82 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SPOCK1	Q08629	439 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	UEVLD	Q8IX04	471 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK11	Q9UBX7	282 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PNV4	684 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TVP23A	A6NH52	213 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	LIPT2	A6NK58	231 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP5D1	E7EU14	171 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BSH0	61 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	B4GALT1	P15291	398 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	CCKAR	P32238	428 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	LPAR6	P43657	344 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC35A1	P78382	337 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4K13	Q8NH42	304 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	RASD2	Q96D21	266 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	PRRC1	Q96M27	445 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	GPA33	Q99795	319 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	IL19	Q9UHD0	177 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms