RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	MTCP1	P56278	107 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ST3GAL4	Q11206	333 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468		J3QLW9	94 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	SIRPB1	O00241	398 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	KDM4B	O94953	1096 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OR2H2	O95918	312 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1D-12	P01611	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PF4	P02776	101 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LPL	P06858	475 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC159	P0C7I6	412 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF19	P17023	458 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ATF1	P18846	271 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CRHBP	P24387	322 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	GDNF	P39905	211 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	HSPA13	P48723	471 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM80	Q96HE8	168 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	COL7A1	Q02388	2944 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		11.07	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ODAM	A1E959	279 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FUOM	A2VDF0	154 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468		M0QZK8	103 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	SH2D1B	O14796	132 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OGG1	O15527	345 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ZFPL1	O95159	310 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	MT-ND2	P03891	347 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CDK1	P06493	297 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CALCB	P10092	127 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CEACAM3	P40198	252 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	GLIPR1	P48060	266 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OSR2	Q8N2R0	312 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OR52N1	Q8NH53	320 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.06	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	PTGFR	P43088	359 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	AES	Q08117	197 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468		Q6P435	159 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FGGY	Q96C11	551 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	COQ2	Q96H96	371 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	IRGM	A1A4Y4	181 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64
MUC1-222	ENST00000610468	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		11.04	□□□□□ -0.64

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