RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTBP60709 375 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 RAP1BP61224 184 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 RAP1AP62834 184 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTG1P63261 375 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 PLP2Q04941 152 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 BAMBIQ13145 260 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC18B1Q6NT16 456 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 ETV3LQ6ZN32 361 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 DTX2Q86UW9 622 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SEH1LQ96EE3 360 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SHARPINQ9H0F6 387 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 NIT2Q9NQR4 276 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 MED9Q9NWA0 146 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 COL6A5A8TX70 2615 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 A4D1N5 150 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 KRBOX1C9JBD0 128 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SNAPC5O75971 98 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 HTR2CP28335 458 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 MPV17P39210 176 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 LY6G6FQ5SQ64 297 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 PDZD9Q8IXQ8 264 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 BVESQ8NE79 360 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1J1Q8NGS3 322 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2J1Q9GZK6 312 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 CD2P06729 351 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF2P09038 288 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 APLNRP35414 380 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 TAS2R19P59542 299 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL8P80075 99 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM27BQ5VT28 67 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM166AQ6J272 317 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 JAGN1Q8N5M9 183 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 BHLHE23Q8NDY6 225 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1J2Q8NGS2 313 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 CKLFQ9UBR5 152 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 LRP12Q9Y561 859 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 C5orf63A6NC05 138 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SIGLEC5O15389 551 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC2A1P11166 492 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 RPA2P15927 270 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 ACHEP22303 614 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 CFPP27918 469 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SLAQ13239 276 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 MOGAT2Q3SYC2 334 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRNQ5BIV9 151 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX30Q5JUR7 227 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 GLT8D1Q68CQ7 371 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A28Q96A46 364 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD6Q9BV23 337 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 MSL2Q9HCI7 577 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM235A6NFC5 223 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 CYB5AP00167 134 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 UCP2P55851 309 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 MPPED2Q15777 294 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 NKPD1Q17RQ9 610 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D28Q2M2D7 210 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4S1Q8NGB4 309 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC107Q8WV48 283 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 IL19Q9UHD0 177 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 LHFPL6Q9Y693 200 aa10.65□□□□□ -0.7
RABGEF1-209ENST00000607882 LRP5LA4QPB2 252 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 F5H5K5 113 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 CCSO14618 274 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB13P51153 203 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 DEFA6Q01524 100 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF546Q86UE3 836 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5AS1Q8N127 324 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A40Q8TBP6 338 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 ASB17Q8WXJ9 295 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 C18orf12Q96KH6 178 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 POM121L2Q96KW2 1035 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 APOC3P02656 99 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 SELEP16581 610 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 DHRS2Q13268 280 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.64□□□□□ -0.71
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf198Q9H425 327 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms