RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf105Q8TEF2 133 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ST8SIA4Q92187 359 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ERGIC1Q969X5 290 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CREB3L1Q96BA8 519 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 WDFY2Q96P53 400 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 NEDD4LQ96PU5 975 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SOSTQ9BQB4 213 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SRRQ9GZT4 340 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SHARPINQ9H0F6 387 aa5□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 DLL4Q9NR61 685 aa5□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 GHRLQ9UBU3 117 aa5□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 VWC2LB2RUY7 222 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM157AC9JC47 383 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 TK1P04183 234 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 CHRM2P08172 466 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 WNT2P09544 360 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL3L1P16619 93 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 FUT3P21217 361 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CD40LGP29965 261 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 MDH2P40926 338 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF273Q14593 569 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 LTC4SQ16873 150 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 MPV17LQ2QL34 196 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52W1Q6IF63 320 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 SDSLQ96GA7 329 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMD4Q96H15 378 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 Q96MF0 132 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TSC22D3Q99576 134 aa4.99□□□□□ -1.61
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CAPNS1-208ENST00000589162 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DIABLOQ9NR28 239 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCB10Q9NRK6 738 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 C19orf12Q9NSK7 152 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 RASL12Q9NYN1 266 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 KLK11Q9UBX7 282 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM30Q9UKF2 790 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 MEIKINA0A087WXM9 373 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 C22orf46C9J442 243 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 K7N7A8 449 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 M0QYG6 137 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
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