RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	PDCD6	O75340	191 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	CA11	O75493	328 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	AVP	P01185	164 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	MMP9	P14780	707 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	TGFBR1	P36897	503 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	TMBIM6	P55061	237 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	VBP1	P61758	197 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	NCS1	P62166	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	ARF6	P62330	175 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	AES	Q08117	197 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	RAB12	Q6IQ22	244 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	CORO2A	Q92828	525 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	UPRT	Q96BW1	309 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	COQ2	Q96H96	371 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	WDFY2	Q96P53	400 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	KCNK15	Q9H427	330 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PKN1-208	ENST00000586900	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PPE2	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PR64	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PRV1	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ODAM	A1E959	279 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CRLF1	O75462	422 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TOX4	O94842	621 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	FSHB	P01225	129 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RBP4	P02753	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CHAT	P28329	748 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SERPINB10	P48595	397 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	BLMH	Q13867	455 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	EDDM3A	Q14507	147 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	USP43	Q70EL4	1123 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	GAPT	Q8N292	157 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		Q8N7P7	452 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NANP	Q8TBE9	248 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0A6YYD4	124 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	HSPB6	O14558	160 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	PRTN3	P24158	256 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	GLIPR1	P48060	266 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	DLX6	P56179	175 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	BPIFB3	P59826	476 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF273	Q14593	569 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	IDNK	Q5T6J7	187 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TCF23	Q7RTU1	214 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF714	Q96N38	554 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	KIF25	Q9UIL4	384 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0B4J203	849 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SOCS1	O15524	211 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	SCGN	O76038	276 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	MT-ND4	P03905	459 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CGB3	P0DN86	165 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PKN1-208	ENST00000586900	CGB7	P0DN87	165 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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