RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR173Q9NS66 373 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NAT8Q9UHE5 227 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.68□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RP1P56715 2156 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 F5P12259 2224 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PNR3 127 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PPE3 182 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 IGSF23A1L1A6 192 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5B21A6NL26 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 C9J4A7 227 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BKO60814 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2J2O76002 312 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-HP01893 362 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BJP06899 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINE2P07093 398 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PAX1P15863 534 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CBR1P16152 277 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BOP23527 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 F2RP25116 425 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 GNRHRP30968 328 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BBP33778 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFA6P56556 154 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BDP58876 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BCP62807 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LCN2P80188 198 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TFF2Q03403 129 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CHAF1BQ13112 559 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 Q3ZCU0 254 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SSX9Q7RTT3 188 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8IYB0 196 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8WTZ3 238 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 EXTL1Q92935 676 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TP53RKQ96S44 253 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 IMMP2LQ96T52 175 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SPSB2Q99619 263 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR13Q9NZ81 148 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 HTTP42858 3142 aa6.67□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf51A8MQB3 221 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 H0YL77 283 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 CYB5BO43169 146 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SSSCA1O60232 199 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 WISP1O95388 367 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SERPINA7P05543 415 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 FGF5P12034 268 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DDTP30046 118 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 OPRM1P35372 400 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 AKR1C3P42330 323 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 DYNLT3P51808 116 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SP6Q3SY56 376 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 PYY3Q5JQD4 70 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 RAET1LQ5VY80 246 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF787Q6DD87 383 aa6.66□□□□□ -1.34
CAPNS1-202ENST00000586851 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.66□□□□□ -1.34
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