RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 NCS1P62166 190 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 AESQ08117 197 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 Q6P435 159 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 C17orf107Q6ZR85 190 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 FGFRL1Q8N441 504 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 BPIFB2Q8N4F0 458 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 Q96M66 194 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 DMRTB1Q96MA1 342 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 GFI1Q99684 422 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 ATG5Q9H1Y0 275 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 IFT22Q9H7X7 185 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM160Q9NX00 188 aa11.46□□□□□ -0.57
TRAF4-215ENST00000584944 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.46□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 SHISA3A0PJX4 238 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM127O75204 238 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 PDCD6O75340 191 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 CSN2P05814 226 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 SRD5A1P18405 259 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 SOX6P35712 828 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 LYPD6Q86Y78 171 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 SLC25A28Q96A46 364 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 WDFY2Q96P53 400 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 KCNK15Q9H427 330 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 RAB9BQ9NP90 201 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 ETAA1Q9NY74 926 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 OR6C3Q9NZP0 311 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 KPTNQ9Y664 436 aa11.45□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 ODAMA1E959 279 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 UBE2QL1A1L167 161 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 SCGNO76038 276 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 GABARAPO95166 117 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 GLAP06280 429 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 FAM157CP0CG43 387 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 CD37P11049 281 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 RAB6AP20340 208 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 ERP29P30040 261 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 GLP1RP43220 463 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 VEGFCP49767 419 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 RORCP51449 518 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TMBIM6P55061 237 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 GPR157Q5UAW9 335 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 BRICD5Q6PL45 260 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 AP3S1Q92572 193 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF714Q96N38 554 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 ETV7Q9Y603 341 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.44□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.584e-21■■■■□ 21.6
TRAF4-215ENST00000584944 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 A0A0B4J203 849 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 M0R1W7 72 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF728P0DKX0 622 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 CFPP27918 469 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TGFBR1P36897 503 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 RPS19P39019 145 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 GLIPR1P48060 266 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 SCAND1P57086 179 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 PAX8Q06710 450 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 UNC119Q13432 240 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 LGALS14Q8TCE9 139 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 PTX4Q96A99 478 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 RAB3CQ96E17 227 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 DCSTAMPQ9H295 470 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 KIF25Q9UIL4 384 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 A0A075B6Q4 140 aa11.42□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 CA11O75493 328 aa11.42□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 FPR2P25090 351 aa11.42□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 ERVFRD-1P60508 538 aa11.42□□□□□ -0.58
TRAF4-215ENST00000584944 GUCA2AQ02747 115 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms