RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 OXTP01178 125 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 APOC3P02656 99 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ADRA2AP08913 450 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PSG2P11465 335 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 SELEP16581 610 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF134P52741 427 aa4.71□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.71□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 C19orf48Q6RUI8 117 aa4.71□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 SERPINA11Q86U17 422 aa4.71□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 OR1N2Q8NGR9 330 aa4.71□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR5W2Q8NH69 310 aa4.71□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 SLC35E1Q96K37 410 aa4.71□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 OARD1Q9Y530 152 aa4.71□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 J3QR06 171 aa4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF682O95780 498 aa4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 TMEM225BP0DP42 221 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PGCP20142 388 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 S100A3P33764 101 aa4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 RFX2P48378 723 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 AMTP48728 403 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 ARG2P78540 354 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 CD164Q04900 197 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 FMODQ06828 376 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 PPP1R1AQ13522 171 aa4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 P2RY6Q15077 328 aa4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 CT45A2Q5DJT8 189 aa4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 C10orf111Q8N326 155 aa4.7□□□□□ -1.66
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CAPN3-211ENST00000562199 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 OR5A2Q8NGI9 324 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 UPRTQ96BW1 309 aa4.7□□□□□ -1.66
CAPN3-211ENST00000562199 GPR146Q96CH1 333 aa4.7□□□□□ -1.66
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