RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 HPCAP84074 193 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 IFFO1Q0D2I5 559 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 NDUFAF6Q330K2 333 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 HEATR5AQ86XA9 2040 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 RDH10Q8IZV5 341 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 MREGQ8N565 214 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 WDR31Q8NA23 367 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 OR4A15Q8NGL6 344 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 AGR3Q8TD06 166 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TCP10LQ8TDR4 215 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 C10orf105Q8TEF2 133 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TESCQ96BS2 214 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 ROPN1LQ96C74 230 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 NEURL3Q96EH8 262 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 ARL5BQ96KC2 179 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 OXGR1Q96P68 337 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 EBF4Q9BQW3 602 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 NICN1Q9BSH3 213 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf50Q9BV19 199 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 DPY30Q9C005 99 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 SLC7A10Q9NS82 523 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TREM2Q9NZC2 230 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 LGALS13Q9UHV8 139 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 VSIG4Q9Y279 399 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 V9GY05 133 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 JMJD1CQ15652 2540 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 A0A096LPI6 279 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0G2JRQ6 117 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 SPAG7O75391 227 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 SNAPINO95295 136 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 KRT75O95678 551 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM50AO95807 157 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 DBIP07108 87 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 PTNP21246 168 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CXCR1P25024 350 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 S100A3P33764 101 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 KIR2DS4P43632 304 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 RPL14P50914 215 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 GPM6AP51674 278 aa4.24□□□□□ -1.73
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TMOD3-208ENST00000560725 AAED1Q7RTV5 226 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CLECL1Q8IZS7 167 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 OR4F15Q8NGB8 312 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 OR1L6Q8NGR2 347 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC115Q96NT0 180 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TAPBPLQ9BX59 468 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 OR11A1Q9GZK7 315 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CALML5Q9NZT1 146 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 ROS1P08922 2347 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM72A0PK05 275 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 HMGN4O00479 90 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CST1P01037 141 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 SERPINE1P05121 402 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 IL6P05231 212 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TFPTP0C1Z6 253 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 VHLP40337 213 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
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TMOD3-208ENST00000560725 RCN1Q15293 331 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF621Q6ZSS3 439 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-208ENST00000560725 CROCCP2Q86T23 111 aa4.23□□□□□ -1.73
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