RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556272.1

PCNX1-211, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 2

Gene PCNX1, Length 2,942 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-211ENST00000556272 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CBY3A6NI87 242 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 A6NNC1 897 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 FAM157CP0CG43 387 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ARFRP1Q13795 201 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 RTP5Q14D33 572 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 KISS1Q15726 138 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 OR5B2Q96R09 309 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 RP1P56715 2156 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF98A6NK75 572 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 H7C2Y5 167 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 RAD51DO75771 328 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 SPP1P10451 314 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 LIPCP11150 499 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF44P15621 663 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 DTYMKP23919 212 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 PMELP40967 661 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CSNK1A1P48729 337 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 HMGN3Q15651 99 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 FAM57BQ71RH2 274 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 SKA3Q8IX90 412 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 SPTSSAQ969W0 71 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 RASL10BQ96S79 203 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 S100A13Q99584 98 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 PARP11Q9NR21 331 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 GJE1A6NN92 205 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 H0YIZ8 118 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 JTBO76095 146 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CST4P01036 141 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 IFNA2P01563 188 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 SULT1A2P50226 295 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CAV2P51636 162 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 TSC22D1Q15714 1073 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 OPN5Q6U736 354 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 DEFB119Q8N690 84 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ITGB1BP1O14713 200 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 RER1O15258 196 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 OR2J2O76002 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 HPNP05981 417 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 SMCO1Q147U7 214 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ASCL4Q6XD76 172 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 TMEM123Q8N131 208 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 LRTM2Q8N967 370 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 NABP1Q96AH0 204 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 OR6C1Q96RD1 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ANGPTL4Q9BY76 406 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 EHFQ9NZC4 300 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ACTL6AO96019 429 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 GLI4P10075 376 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 FGF5P12034 268 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 G0S2P27469 103 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 OR3A1P47881 315 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 GNG10P50151 68 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 RAB9AP51151 201 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 FAM3AP98173 230 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 MFAP5Q13361 173 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.35□□□□□ -1.39
PCNX1-211ENST00000556272 M1APQ8TC57 530 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms