RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555628.5

PRKCH-218, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-218ENST00000555628 AQP11Q8NBQ7 271 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 TMEM104Q8NE00 496 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 BBS1Q8NFJ9 593 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 OR9G1Q8NH87 305 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 DCUN1D4Q92564 292 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 RPEQ96AT9 228 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 CCDC140Q96MF4 163 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 KLK15Q9H2R5 256 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 KIAA1456Q9P272 454 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 COPS3Q9UNS2 423 aa7□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 CCDC182A6NF36 153 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 J3QR06 171 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 NDUFAB1O14561 156 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 PTGFRP43088 359 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 CDC42P60953 191 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 PSME3P61289 254 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ZNF616Q08AN1 781 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 HNF4GQ14541 408 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 HAGHQ16775 308 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ACSM6Q6P461 480 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 COMMD2Q86X83 199 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 LILRB2Q8N423 598 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 MNTQ99583 582 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 SPATA25Q9BR10 227 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.99□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 TOR1AO14656 332 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 OVOL1O14753 267 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ARPC2O15144 300 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ZNF254O75437 659 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 OR2H2O95918 312 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 HSD17B1P14061 328 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 BCL3P20749 454 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 KIR3DL2P43630 455 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 RAB7AP51149 207 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 PRRX1P54821 245 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 AESQ08117 197 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 Q6P435 159 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 Q8IYB0 196 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 LEAP2Q969E1 77 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 KCTD7Q96MP8 289 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 GON7Q9BXV9 100 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 CHST5Q9GZS9 411 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 HMG20AQ9NP66 347 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 PSG11Q9UQ72 335 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 X6R8D5 127 aa6.98□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 SIRPB1O00241 398 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 TNFRSF11BO00300 401 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 SAP30O75446 220 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 CCNB2O95067 398 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 IGKV1D-12P01611 117 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 GYS2P54840 703 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 MADCAM1Q13477 382 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 HES1Q14469 280 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 MICAQ29983 383 aa6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PRKCH-218ENST00000555628 CPOQ8IVL8 374 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms