RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 CCL19Q99731 98 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 SRRQ9GZT4 340 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 LIME1Q9H400 295 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NLKQ9UBE8 527 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 NPTNQ9Y639 398 aa6.72□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 TENM4Q6N022 2769 aa6.71□□□□□ -1.33
BEST3-211ENST00000552295 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.71□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 OR2AT4A6NND4 320 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 LGALS8O00214 317 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PDCD6O75340 191 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OR2H2O95918 312 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 HAND1O96004 215 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 TFF1P04155 84 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 LYNX1P0DP58 116 aa6.71□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 PTHLHP12272 177 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 EFNA4P52798 201 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 KRTAP10-9P60411 292 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 IL18Q14116 193 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF846Q147U1 533 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 HFEQ30201 348 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 STUMQ69YW2 141 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CD177Q8N6Q3 437 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CHST4Q8NCG5 386 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ST8SIA4Q92187 359 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 RDH5Q92781 318 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 RAB3CQ96E17 227 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PECRQ9BY49 303 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 IFT22Q9H7X7 185 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF222Q9UK12 451 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 HSF4Q9ULV5 492 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.71□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 LRRK2Q5S007 2527 aa6.7□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 MEIOCA2RUB1 952 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 TMEM235A6NFC5 223 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 OOEPA6NGQ2 149 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PPIAL4DF5H284 164 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 J3QRK9 145 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SIRPB1O00241 398 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SH2D1BO14796 132 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DEGS1O15121 323 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CTDSPLO15194 276 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 FSTL3O95633 263 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 IGHV4-39P01824 125 aa6.7□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DAOP14920 347 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZNF44P15621 663 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GNB3P16520 340 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 FUT3P21217 361 aa6.7□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 CD40LGP29965 261 aa6.7□□□□□ -1.34
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BEST3-211ENST00000552295 PITPNAQ00169 270 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SCN1BQ07699 218 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ZMYND11Q15326 602 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 CDNFQ49AH0 187 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 PYDC2Q56P42 97 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 Q6ZTK2 550 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.7□□□□□ -1.34
BEST3-211ENST00000552295 GPHA2Q96T91 129 aa6.7□□□□□ -1.34
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