RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 OR3A1P47881 315 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR3A4PP47883 348 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 NPBWR2P48146 333 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 DAPP51397 102 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 HES1Q14469 280 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 FAHD1Q6P587 224 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TCF23Q7RTU1 214 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OSR2Q8N2R0 312 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CORO2AQ92828 525 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RFKQ969G6 155 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RPEQ96AT9 228 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RDH12Q96NR8 316 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ASCL2Q99929 193 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ING3Q9NXR8 418 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 GNG8Q9UK08 70 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.73□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ODAMA1E959 279 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SERPINE3A8MV23 424 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 G3V2T6 193 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 M0R129 80 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 DEGS1O15121 323 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR2H2O95918 312 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CCDC159P0C7I6 412 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 HTR1FP30939 366 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 MYCNOSP40205 109 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 GLIPR1P48060 266 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RAB25P57735 213 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 AESQ08117 197 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TMED1Q13445 227 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 UTS2BQ765I0 119 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF329Q86UD4 541 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 COMMD1Q8N668 190 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 CHST4Q8NCG5 386 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR9G1Q8NH87 305 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TFAP2CQ92754 450 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 TOMM40LQ969M1 308 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 SPSB1Q96BD6 273 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 FGGYQ96C11 551 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OPALINQ96PE5 141 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 RHOFQ9HBH0 211 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 HMG20AQ9NP66 347 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZFP57Q9NU63 452 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.72□□□□□ -1.33
TROAP-208ENST00000548817 ZAR1LA6NP61 321 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 APOL3O95236 402 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 IGLV1-47P01700 117 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 TMEM11P17152 192 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 CD34P28906 385 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 LSAMPQ13449 338 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ATP6AP1Q15904 470 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 TP53I3Q53FA7 332 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 TTC23Q5W5X9 447 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 C12orf73Q69YU5 71 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 SSX6Q7RTT6 188 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 RDH10Q8IZV5 341 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 RFT1Q96AA3 541 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ISOC1Q96CN7 298 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 HHLA2Q9UM44 414 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.71□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.7□□□□□ -1.34
TROAP-208ENST00000548817 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.7□□□□□ -1.34
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