RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.49□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 PPA2Q9H2U2 334 aa6.49□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.49□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.49□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.49□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM235A6NFC5 223 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SERPINE3A8MV23 424 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 A8MXK9 166 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 H3BUI4 141 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 DVL1O14640 695 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TMPRSS2O15393 492 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ADAM20O43506 726 aa6.48□□□□□ -1.37
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C16orf62-211ENST00000540101 SLC25A16P16260 332 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 GNB3P16520 340 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 IL2RGP31785 369 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 KCNJ3P48549 501 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 PAX2Q02962 417 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 KCNJ8Q15842 424 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 CARTPTQ16568 116 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 CDNFQ49AH0 187 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.48□□□□□ -1.37
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C16orf62-211ENST00000540101 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 Q6ZTK2 550 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 C1orf159Q96HA4 380 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 MED30Q96HR3 178 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SNX22Q96L94 193 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 Q96MF0 132 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SRRQ9GZT4 340 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 CHST6Q9GZX3 395 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 DIABLOQ9NR28 239 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 AK3Q9UIJ7 227 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.48□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ARID1AO14497 2285 aa6.48□□□□□ -1.37
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C16orf62-211ENST00000540101 MEIOCA2RUB1 952 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ISPDA4D126 451 aa6.47□□□□□ -1.37
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C16orf62-211ENST00000540101 FAM25CB3EWG5 89 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 FAM25GB3EWG6 89 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 C22orf46C9J442 243 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 HSPB6O14558 160 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 MGST3O14880 152 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 CTDSPLO15194 276 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 MT-ND4P03905 459 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 CGB3P0DN86 165 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 CGB7P0DN87 165 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 S100A5P33763 92 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TALDO1P37837 337 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 GABRA2P47869 451 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 P2RX3P56373 397 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 GUCA2AQ02747 115 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SCN1BQ07699 218 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 MADCAM1Q13477 382 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ARL6IP1Q15041 203 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 GRK1Q15835 563 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 CR1LQ2VPA4 569 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 GPX8Q8TED1 209 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM63Q969Q1 353 aa6.47□□□□□ -1.37
C16orf62-211ENST00000540101 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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