RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 CDH26Q8IXH8 852 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 AQP3Q92482 292 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM203Q969S6 136 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 MUL1Q969V5 352 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.46□□□□□ -0.57
UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1W2PPK0 400 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 MAGEA13PA6NCF6 341 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 J3QT63 122 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 F2RL2O00254 374 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 MAGEB3O15480 346 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TFF1P04155 84 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 UCHL1P09936 223 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 SRMP19623 302 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 COX7A1P24310 79 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 GP2P55259 537 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 RPS25P62851 125 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP3R1P63098 170 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 IL24Q13007 206 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 NEDD8Q15843 81 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 PLA1AQ53H76 456 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM219Q86XT9 240 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 CALHM1Q8IU99 346 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 RASL12Q9NYN1 266 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.45□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 H3BUI4 141 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 CD37P11049 281 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 BDKRB2P30411 391 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ERVFRD-1P60508 538 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 CD83Q01151 205 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 FABP5Q01469 135 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 INSL4Q14641 139 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 KISS1Q15726 138 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ANGPTL5Q86XS5 388 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 OR51A2Q8NGJ7 313 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 A6NDX4 124 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 GABRPO00591 440 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 RHBDL1O75783 438 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ARL6IP5O75915 188 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 HCKP08631 526 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 PGA5P0DJD9 388 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 SMIM18P0DKX4 95 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 PSG2P11465 335 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 RAB13P51153 203 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 KRTAP10-11P60412 298 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 RPL31P62899 125 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 POC1AQ8NBT0 407 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ORAI1Q96D31 301 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 RHOFQ9HBH0 211 aa11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 SYNGR1O43759 233 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 CYB5AP00167 134 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ARG1P05089 322 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ERVK11-1P61568 191 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ASCL4Q6XD76 172 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 LYPD6Q86Y78 171 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 MALSU1Q96EH3 234 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 SDSLQ96GA7 329 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 HES4Q9HCC6 221 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF222Q9UK12 451 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 STUB1Q9UNE7 303 aa11.42□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa11.41□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 MAS1P04201 325 aa11.41□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 CD36P16671 472 aa11.41□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 PSMD7P51665 324 aa11.41□□□□□ -0.58
UBASH3B-202ENST00000525711 ZP1P60852 638 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms