RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00303Q3SY05 128 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A28Q96A46 364 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 APH1AQ96BI3 265 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.85□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0D9SG52 128 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CCL2P13500 99 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PGAM2P15259 253 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GNB3P16520 340 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MAS1LP35410 378 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 AKR1C3P42330 323 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R19P59542 299 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HGFACQ04756 655 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 LYG1Q8N1E2 194 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GFI1Q99684 422 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RAB22AQ9UL26 194 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PINLYPA6NC86 204 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ACTL6AO96019 429 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HLA-HP01893 362 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HKR1P10072 659 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GZMBP10144 247 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF17P17021 662 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 AKR1C4P17516 323 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 AMY2BP19961 511 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 CD1BP29016 333 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF766Q5HY98 468 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 MFRPQ9BY79 579 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 COMMD9Q9P000 198 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ANGPTL7O43827 346 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 GCGP01275 180 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 ARG1P05089 322 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PMP22Q01453 160 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 OR2A2Q6IF42 318 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 FAM206AQ9NX38 181 aa6.84□□□□□ -1.31
TRPS1-208ENST00000519076 H0Y8G0 127 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 DFFBO76075 338 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 IL18BPO95998 194 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR3A4PP47883 348 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 MALLQ13021 153 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PCK2Q16822 640 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 REEP6Q96HR9 211 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 TP53RKQ96S44 253 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 MICU1Q9BPX6 476 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 MMP26Q9NRE1 261 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GUH1 482 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PP11 408 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf49A4QMS7 147 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC3BP05452 202 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SP1P08047 785 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SOD3P08294 240 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CST2P09228 141 aa6.83□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 APLNRP35414 380 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms