RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512392.5

CHD1-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene CHD1, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-208	ENST00000512392	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PDCD6	O75340	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	UPK1B	O75841	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	KCNK2	O95069	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RBP2	P50120	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	DEFA3	P59666	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	GPER1	Q99527	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	NPAT	Q14207	1427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	KIF15	Q9NS87	1388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392		D6RAR5	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	OR4A8	P0C604	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	VDAC1	P21796	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MYL9	P24844	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	EMX2	Q04743	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PNOC	Q13519	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FZD2	Q14332	565 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	NDUFS5	O43920	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	S100A8	P05109	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PRTN3	P24158	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MPG	P29372	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	AGTR1	P30556	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	PHB	P35232	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	REG3A	Q06141	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	FAM151A	Q8WW52	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	CACNA1S	Q13698	1873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	MYH3	P11055	1940 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392		G3V2T6	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392		I3L4J1	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	TCF21	O43680	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	IGHM	P01871	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHD1-208	ENST00000512392	IFNA4	P05014	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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