RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PPE2	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PR64	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PRV1	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	HTR3B	O95264	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	UCHL1	P09936	223 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SERPINA2	P20848	420 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	LMO1	P25800	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	OR3A1	P47881	315 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	MUL1	Q969V5	352 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	LRRC42	Q9Y546	428 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0G2JK05	382 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	DEGS1	O15121	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	NPFF	O15130	113 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	CSN2	P05814	226 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SCN1B	Q07699	218 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF273	Q14593	569 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148		Q6P435	159 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	OSR2	Q8N2R0	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	hADV38S2	A0JD32	116 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TSPAN9	O75954	239 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	RBP4	P02753	201 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	FBP1	P09467	338 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GTF2F2	P13984	249 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SRM	P19623	302 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SAA4	P35542	130 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	P2RX3	P56373	397 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	MPV17L	Q2QL34	196 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	PIGY	Q3MUY2	71 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	LYPD6	Q86Y78	171 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	AJUBA	Q96IF1	538 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	CCRL2	O00421	344 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	CCL3L1	P16619	93 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	PSMB9	P28065	219 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	FABP5	Q01469	135 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SSX1	Q16384	188 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GHRL	Q9UBU3	117 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	UBB	P0CG47	229 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	PAX6	P26367	422 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	KCNJ3	P48549	501 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	CST11	Q9H112	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PP11	408 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	C17orf98	A8MV24	154 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	HSPB6	O14558	160 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MIB2-223	ENST00000508148	GAL	P22466	123 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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