RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 CHP2O43745 196 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PLIN3O60664 434 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC22O60826 627 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ARL6IP5O75915 188 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CA2P00918 260 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CXCL3P19876 107 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 P2RY4P51582 365 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CRYBA4P53673 196 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 DIO3P55073 304 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TNFRSF9Q07011 255 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ADIGQ0VDE8 80 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF79Q15937 498 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 GSG1Q2KHT4 349 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM215Q68D42 235 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF544Q6NX49 715 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 OPN5Q6U736 354 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 DCAKDQ8WVC6 231 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 YIPF5Q969M3 257 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SIGMAR1Q99720 223 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PCBD2Q9H0N5 130 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PARVAQ9NVD7 372 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SMPXQ9UHP9 88 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 HHLA2Q9UM44 414 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM131Q92545 1883 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PBRM1Q86U86 1689 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CLUHO75153 1309 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PGPA6NDG6 321 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF878C9JN71 531 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 C15orf65H3BRN8 121 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 M0R1X1 148 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 LAD1O00515 517 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 FFAR1O14842 300 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 REG1AP05451 166 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CECR9P0C854 216 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CD36P16671 472 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF708P17019 499 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CXCL2P19875 107 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A1P30531 599 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CDK9P50750 372 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 RAB5BP61020 215 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 IHHQ14623 411 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 LIN52Q52LA3 116 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ACSBG2Q5FVE4 666 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 HES5Q5TA89 166 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 NAA40Q86UY6 237 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM86BQ8N661 226 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 NPBQ8NG41 125 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 TMBIM1Q969X1 311 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 NEURL3Q96EH8 262 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 BTF3L4Q96K17 158 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 RNF157Q96PX1 679 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PLEKHF1Q96S99 279 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 MED18Q9BUE0 208 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PAXXQ9BUH6 204 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ASTN1O14525 1302 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ZBED9Q6R2W3 1325 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 UPK1AO00322 258 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 SERPINB7O75635 380 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 GABARAPO95166 117 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 IFNA21P01568 189 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 HLA-DPB1P04440 258 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 HMGN1P05114 100 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 ALDH3A1P30838 453 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 GFERP55789 205 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 H2BFSP57053 126 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 CRADDP78560 199 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-215ENST00000506510 IFITM2Q01629 132 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.6 ms