RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 LYZL4Q96KX0 146 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCA4P78363 2273 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PPH5 198 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 SPEM2Q0P670 501 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 IGFBP7Q16270 282 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PPE2 198 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 E9PLN8 166 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 MELTFP08582 738 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB13P51153 203 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 SSPNQ14714 243 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 CSRP2Q16527 193 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5B12Q96R08 314 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 DMRTA2Q96SC8 542 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 CDIPTO14735 213 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNA1P01562 189 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF708P17019 499 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 S100PP25815 95 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM58AQ8N1B3 248 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM230Q96A57 120 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 PFDN5Q99471 154 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 CACNG5Q9UF02 275 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC22A20A6NK97 555 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 SHISA7A6NL88 538 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 TTLL8A6PVC2 850 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNA10P01566 189 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNA4P05014 189 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 CST2P09228 141 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 HKR1P10072 659 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 PTAFRP25105 342 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 CALHM1Q8IU99 346 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 ENY2Q9NPA8 101 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.08□□□□□ -0.63
RABGEF1-211ENST00000503687 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNGR1O43759 233 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 HBG1P69891 147 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 HBG2P69892 147 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 MARVELD3Q96A59 401 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR54Q9H977 334 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 PSENENQ9NZ42 101 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 UMODP07911 640 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 MEOX1P50221 254 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 DYNLT3P51808 116 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 GNG3P63215 75 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 CLDN23Q96B33 292 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 TAAR9Q96RI9 348 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 TRANK1O15050 2925 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 SELEP16581 610 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 CEACAM6P40199 344 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 LHX4Q969G2 390 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 Q96M66 194 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 EDEM2Q9BV94 578 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 ARR3P36575 388 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 SELENOVP59797 346 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 REG4Q9BYZ8 158 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 DOCK11Q5JSL3 2073 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PPV4 95 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 FGF5P12034 268 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 NUDT19A8MXV4 375 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 LDLRAD4O15165 306 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 CTXN2P0C2S0 81 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM3AP98173 230 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 HMGN3Q15651 99 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms