RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PECRQ9BY49 303 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CEACAM18A8MTB9 384 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MFNGO00587 321 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 WNT2P09544 360 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 RPS2P15880 293 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 DUSP1P28562 367 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TAS2R20P59543 309 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SCN1BQ07699 218 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G7Q13093 441 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 HACD4Q5VWC8 232 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CD276Q5ZPR3 534 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 BATF2Q8N1L9 274 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GAPTQ8N292 157 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 NEK7Q8TDX7 302 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ST8SIA4Q92187 359 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SEH1LQ96EE3 360 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CCL13Q99616 98 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CHST6Q9GZX3 395 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 RAB9BQ9NP90 201 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CUBNO60494 3623 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SIRPB1O00241 398 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PSPNO60542 156 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CRLF1O75462 422 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF205O95201 554 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 HLA-DQB1P01920 261 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CD3GP09693 182 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 AMY2BP19961 511 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 DTYMKP23919 212 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 PRSS3P35030 304 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 IL18Q14116 193 aa9.73□□□□□ -0.85
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NISCH-211ENST00000488243 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 AVPI1Q5T686 147 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ETAA1Q9NY74 926 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PPH5 198 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TMEM82A0PJX8 343 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GABARAPH6UMI1 98 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 DVL1O14640 695 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 IGHV2-5P01817 119 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CD40LGP29965 261 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR3A1P47881 315 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 GNG2P59768 71 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 LSAMPQ13449 338 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ARFRP1Q13795 201 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF846Q147U1 533 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ESCO2Q56NI9 601 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 C19orf18Q8NEA5 215 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OR6C3Q9NZP0 311 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 CLN8Q9UBY8 286 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 OPN4Q9UHM6 478 aa9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-211ENST00000488243 V9GYH0 126 aa9.72□□□□□ -0.85
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