RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10A3	P58181	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	ARF6	P62330	175 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TAF9	Q16594	264 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	PTX4	Q96A99	478 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ODAM	A1E959	279 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CA11	O75493	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CGB3	P0DN86	165 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CGB7	P0DN87	165 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	EPHA1	P21709	976 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	EDDM3B	P56851	147 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SCAND1	P57086	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	BANF2	Q9H503	90 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.58	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	AIRE	O43918	545 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	PDCD6	O75340	191 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	GABARAP	O95166	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	MPIG6B	O95866	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	FUT3	P21217	361 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CHAT	P28329	748 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SDC2	P34741	201 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	BLMH	Q13867	455 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	EDDM3A	Q14507	147 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	OR10K2	Q6IF99	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0A6YYD4	124 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CCL3L1	P16619	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB6A	P20340	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	GLIPR1	P48060	266 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	GUCA2A	Q02747	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	SCN1B	Q07699	218 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	AES	Q08117	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	P2RY14	Q15391	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PPE2	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PR64	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1W2PRV1	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2E1	P51965	193 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	CLDN12	P56749	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	HES5	Q5TA89	166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB12	Q6IQ22	244 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A087X0M5	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A1B0GX30	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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