RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	SERPINE3	A8MV23	424 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OOSP1	A8MZH6	123 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GNGT2	O14610	69 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ARPC2	O15144	300 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC159	P0C7I6	412 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PSKH1	P11801	424 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	LYL1	P12980	280 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	HSD17B1	P14061	328 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ANOS1	P23352	680 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PRDX6	P30041	224 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MYCNOS	P40205	109 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	THBS3	P49746	956 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	BNIP1	Q12981	228 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	IL24	Q13007	206 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GK3P	Q14409	553 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	HES1	Q14469	280 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GRK1	Q15835	563 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ACSM6	Q6P461	480 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	C16orf89	Q6UX73	402 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CD177	Q8N6Q3	437 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MUC7	Q8TAX7	377 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	RPE	Q96AT9	228 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF488	Q96MN9	340 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	NEU1	Q99519	415 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MED20	Q9H944	212 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GPR84	Q9NQS5	396 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	VNN3	Q9NY84	501 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388		U3KQV3	271 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		3.75	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388		H0YHG0	523 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CCL24	O00175	119 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SH2D1B	O14796	132 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MGST3	O14880	152 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SELENOF	O60613	162 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	HAND1	O96004	215 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	SEMG1	P04279	462 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ALOX5AP	P20292	161 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CDK2	P24941	298 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CD24	P25063	80 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	MPZ	P25189	248 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	DUSP1	P28562	367 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR3A4P	P47883	348 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FUT6	P51993	359 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CDC42	P60953	191 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	BDH1	Q02338	343 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FHL3	Q13643	280 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	APOF	Q13790	326 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TEX38	Q6PEX7	206 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF695	Q8IW36	515 aa		3.74	□□□□□ -1.81
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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