RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 CISHQ9NSE2 258 aa2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 TREX1Q9NSU2 369 aa2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 DMAC2Q9NW81 257 aa2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC168Q8NDH2 2452 aa2.47□□□□□ -2.01
ITGB3BP-211ENST00000478538 SDK2Q58EX2 2172 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 MKRN2OSH3BPM6 223 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 NDUFS8O00217 210 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TAAR5O14804 337 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 CALUO43852 315 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 STX10O60499 249 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 APCSP02743 223 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 IVLP07476 585 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRT7P08729 469 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 AZU1P20160 251 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 GGT2P36268 569 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TALDO1P37837 337 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIR3DL2P43630 455 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 PFN3P60673 137 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 PAFAH1B2P68402 229 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 STK11Q15831 433 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 DEFB109BQ30KR1 87 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 GKN2Q86XP6 184 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 UBAC2Q8NBM4 344 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR4K5Q8NGD3 323 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 UBALD1Q8TB05 177 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 CACNG8Q8WXS5 425 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM234Q8WY98 164 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 NEURL3Q96EH8 262 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 KCNS1Q96KK3 526 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM243Q9BU79 118 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 DDA1Q9BW61 102 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR51B5Q9H339 312 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARMC7Q9H6L4 198 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ADA2Q9NZK5 511 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 HS3ST2Q9Y278 367 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 FADS3Q9Y5Q0 445 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 SVILO95425 2214 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCNX1Q96RV3 2341 aa2.46□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANKRD12Q6UB98 2062 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPG11Q96JI7 2443 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 H0YJW9 148 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 K7ERQ8 282 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 M0QYV0 167 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 DFFAO00273 331 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TNFRSF11BO00300 401 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 MED6O75586 246 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 GLSO94925 669 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TNFP01375 233 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 RHOCP08134 193 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 PAEPP09466 180 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR56A5P0C7T3 313 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCL4P13236 92 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDC20Q12834 499 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 PNOCQ13519 176 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 C16orf72Q14CZ0 275 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 MPV17L2Q567V2 206 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 SYPL2Q5VXT5 272 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 FBXW9Q5XUX1 488 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 SAXO2Q658L1 398 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 NANOGP8Q6NSW7 305 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM173BQ6P4H8 233 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 C22orf39Q6P5X5 142 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 TAC4Q86UU9 113 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC30A8Q8IWU4 369 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR6K6Q8NGW6 343 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR52P1PQ8NH57 321 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 OSBPL11Q9BXB4 747 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 HAUS4Q9H6D7 363 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 RDH14Q9HBH5 336 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 FBXO8Q9NRD0 319 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 FLVCR2Q9UPI3 526 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 SIGLEC9Q9Y336 463 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 KLF12Q9Y4X4 402 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR51B4Q9Y5P0 310 aa2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ABCA2Q9BZC7 2435 aa2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARID1AO14497 2285 aa2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 POLEQ07864 2286 aa2.44□□□□□ -2.02
ITGB3BP-211ENST00000478538 MED13LQ71F56 2210 aa2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms