RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TOR1A	O14656	332 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MMP23A	O75900	390 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA7	O95182	113 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	FST	P19883	344 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MYF6	P23409	242 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	HSPA13	P48723	471 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RAB13	P51153	203 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	INSL4	Q14641	139 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SPHAR	Q15513	63 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF626	Q68DY1	528 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR52W1	Q6IF63	320 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	THRSP	Q92748	146 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	DERL3	Q96Q80	235 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PP11	408 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	F2RL2	O00254	374 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RGS10	O43665	173 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CSN2	P05814	226 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GTF2F2	P13984	249 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	DOC2B	Q14184	412 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZSV7	163 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	UFD1	Q92890	307 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		12	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	HTR1D	P28221	377 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	BDH1	Q02338	343 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GPR176	Q14439	515 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	BANF2	Q9H503	90 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	PIN1P1	O15428	100 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GPX5	O75715	221 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GABRA5	P31644	462 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GDNF	P39905	211 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GNG10	P50151	68 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35A2	P78381	396 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	GPR50	Q13585	617 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	CORO2A	Q92828	525 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SSR4-208	ENST00000471880	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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